Это словосочетание произошло в результате реальных исторических событий. Теплой ночью 23 августа 1572 года, в день св. Варфоломея, во французской столице происходили ужасные вещи. В течение нескольких часов солдаты методично вырезали гугенотов, которые выступали за изменение устоев католицизма. Приказ был отдан Римским папой, который провозгласил гугенотов еретиками.
С той поры «Варфоломеевской ночью» называется стремительная и массовая расправа над противником, происходящая с использованием нечестных, подлых методов.

Пример:

«По городу уже носились жуткие слухи, что «черная сотня» намерена устроить «московскую варфоломеевскую ночь», напасть на «врагов царя и отечества» — на Максима Горького и на Художественный театр» (Н. Телешов).
(В ночь на 24 августа 1572г. накануне дня святого Варфоломея в Париже произошло массовое истребление протестантов католиками).