Корень зла — выражение из Библии (Книга Иова) употребляется в значении: основа, первоисточник зла, всего плохого и вредного.
Вам надлежало бы сказать: зачем мы преследуем его? Как будто корень зла найден во мне. Иов, 19, 28.
Ломоносов:

И мужество твои чресла
Скрепит для общей нашей чести,
Защитит нас к противных мести,
Дабы исторгнуть корень зла.