Поступить вопреки своим нравственным принципам, убеждениям.
Да сверх того они в состоянии сознательно идти против совести из слабости на известных пунктах (Достоевский. Униженные и оскорблённые).
Родители поймут, что она не могла идти против совести (Г. Матюшина. За дружбу).