1. Совсем, совершенно (отвергать что-либо, не соглашаться с чем-либо). [Раглан] всем видом своим показывал, что он в корне не согласен с тем, что хотят ему навязать (Сергеев-Ценский. Севастопольская страда).
2. В самом главном, в основе (изменять, ломать что-либо). — Не только в том ценность нашей работы, что мы сушим болота и создаём новую жизнь, что мы в корне уничтожаем старую болотную растительность… насаждаем совершенно новую… Он (смысл) ещё в том, что мы создаём молодое, здоровое поколение (Паустовский. Колхида).